MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD06

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011889	AC	3	6	149	154	50 %	0 %	0 %	50 %	220915102
2	NC_011889	ATCCT	2	10	259	268	20 %	40 %	0 %	40 %	220915102
3	NC_011889	GAT	2	6	294	299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
4	NC_011889	ATC	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
5	NC_011889	CTTAC	2	10	444	453	20 %	40 %	0 %	40 %	220915102
6	NC_011889	TGA	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
7	NC_011889	GGCC	2	8	526	533	0 %	0 %	50 %	50 %	220915102
8	NC_011889	AGA	3	9	599	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
9	NC_011889	AACG	2	8	623	630	50 %	0 %	25 %	25 %	220915102
10	NC_011889	T	6	6	699	704	0 %	100 %	0 %	0 %	220915102
11	NC_011889	AGG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
12	NC_011889	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
13	NC_011889	TGGG	2	8	809	816	0 %	25 %	75 %	0 %	220915102
14	NC_011889	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
15	NC_011889	AAT	3	9	927	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
16	NC_011889	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
17	NC_011889	ATG	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
18	NC_011889	ACG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
19	NC_011889	ATC	2	6	979	984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
20	NC_011889	GAG	2	6	993	998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
21	NC_011889	CCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
22	NC_011889	GGAA	2	8	1091	1098	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
23	NC_011889	TCTG	2	8	1145	1152	0 %	50 %	25 %	25 %	220915102
24	NC_011889	TCA	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
25	NC_011889	AG	3	6	1179	1184	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
26	NC_011889	CAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
27	NC_011889	AGATC	2	10	1192	1201	40 %	20 %	20 %	20 %	220915102
28	NC_011889	GA	4	8	1223	1230	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
29	NC_011889	GA	4	8	1273	1280	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
30	NC_011889	GAAA	2	8	1356	1363	75 %	0 %	25 %	0 %	220915102
31	NC_011889	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220915102
32	NC_011889	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
33	NC_011889	TAA	2	6	1475	1480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
34	NC_011889	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
35	NC_011889	ACC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
36	NC_011889	AGA	2	6	1562	1567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
37	NC_011889	AAC	3	9	1571	1579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
38	NC_011889	CAG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
39	NC_011889	GGTC	2	8	1737	1744	0 %	25 %	50 %	25 %	220915102
40	NC_011889	CTA	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
41	NC_011889	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
42	NC_011889	CG	3	6	2134	2139	0 %	0 %	50 %	50 %	220915103
43	NC_011889	TGC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
44	NC_011889	TCC	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915103
45	NC_011889	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
46	NC_011889	TGA	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915103
47	NC_011889	CAC	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915103
48	NC_011889	GTCA	2	8	2646	2653	25 %	25 %	25 %	25 %	220915103
49	NC_011889	GCC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
50	NC_011889	GCG	2	6	2704	2709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915103
51	NC_011889	GGT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915103
52	NC_011889	TGC	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
53	NC_011889	GC	4	8	3051	3058	0 %	0 %	50 %	50 %	220915104
54	NC_011889	ACCC	2	8	3061	3068	25 %	0 %	0 %	75 %	220915104
55	NC_011889	GCT	2	6	3072	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
56	NC_011889	GCC	2	6	3108	3113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915104
57	NC_011889	CCGA	2	8	3117	3124	25 %	0 %	25 %	50 %	220915104
58	NC_011889	GCTCG	2	10	3135	3144	0 %	20 %	40 %	40 %	220915104
59	NC_011889	GAGC	2	8	3152	3159	25 %	0 %	50 %	25 %	220915104
60	NC_011889	GCTC	2	8	3166	3173	0 %	25 %	25 %	50 %	220915104
61	NC_011889	GGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915104
62	NC_011889	CAA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915104
63	NC_011889	GAA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915104
64	NC_011889	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
65	NC_011889	TGC	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
66	NC_011889	ATC	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915105
67	NC_011889	TCGG	2	8	3647	3654	0 %	25 %	50 %	25 %	220915105
68	NC_011889	CTG	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
69	NC_011889	GGT	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915105
70	NC_011889	C	6	6	3726	3731	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
71	NC_011889	TCG	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
72	NC_011889	CGG	2	6	3750	3755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
73	NC_011889	C	6	6	3858	3863	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
74	NC_011889	CGG	3	9	3882	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
75	NC_011889	C	6	6	3934	3939	0 %	0 %	0 %	100 %	220915105
76	NC_011889	GCC	2	6	4011	4016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915105
77	NC_011889	GGCG	2	8	4319	4326	0 %	0 %	75 %	25 %	220915106
78	NC_011889	GCCC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	25 %	75 %	220915106
79	NC_011889	ACCC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	0 %	75 %	220915106
80	NC_011889	GCGTC	2	10	4391	4400	0 %	20 %	40 %	40 %	220915106
81	NC_011889	CGGA	2	8	4440	4447	25 %	0 %	50 %	25 %	220915106
82	NC_011889	GAT	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
83	NC_011889	CTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915107
84	NC_011889	GCCT	2	8	4622	4629	0 %	25 %	25 %	50 %	220915107
85	NC_011889	GC	3	6	4673	4678	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
86	NC_011889	CGA	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
87	NC_011889	GCTT	2	8	4723	4730	0 %	50 %	25 %	25 %	220915107
88	NC_011889	GCT	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
89	NC_011889	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
90	NC_011889	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915107
91	NC_011889	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
92	NC_011889	CG	3	6	4885	4890	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
93	NC_011889	ATCCTC	2	12	4912	4923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220915107
94	NC_011889	AGC	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
95	NC_011889	ATG	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
96	NC_011889	GATA	2	8	4999	5006	50 %	25 %	25 %	0 %	220915107
97	NC_011889	GAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
98	NC_011889	CG	4	8	5121	5128	0 %	0 %	50 %	50 %	220915107
99	NC_011889	GCG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915107
100	NC_011889	GAC	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
101	NC_011889	ATGG	2	8	5435	5442	25 %	25 %	50 %	0 %	220915108
102	NC_011889	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
103	NC_011889	GCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
104	NC_011889	CCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
105	NC_011889	GCG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
106	NC_011889	GCG	2	6	5790	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
107	NC_011889	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
108	NC_011889	GCA	2	6	5862	5867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
109	NC_011889	CGT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
110	NC_011889	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
111	NC_011889	ATC	2	6	5986	5991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
112	NC_011889	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
113	NC_011889	GGC	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
114	NC_011889	GCG	2	6	6038	6043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
115	NC_011889	CGG	3	9	6069	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
116	NC_011889	TGG	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
117	NC_011889	TGC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
118	NC_011889	GGT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
119	NC_011889	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
120	NC_011889	CAT	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
121	NC_011889	GAG	3	9	6316	6324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915108
122	NC_011889	CGCC	2	8	6402	6409	0 %	0 %	25 %	75 %	220915108
123	NC_011889	CAATGA	2	12	6432	6443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220915108
124	NC_011889	CGA	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
125	NC_011889	ATC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
126	NC_011889	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
127	NC_011889	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
128	NC_011889	AAG	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915108
129	NC_011889	CGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
130	NC_011889	GACG	2	8	6802	6809	25 %	0 %	50 %	25 %	220915108
131	NC_011889	CAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
132	NC_011889	GCAGG	2	10	6982	6991	20 %	0 %	60 %	20 %	220915108
133	NC_011889	GCT	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
134	NC_011889	GCC	2	6	7053	7058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
135	NC_011889	GC	3	6	7214	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	220915108
136	NC_011889	AGC	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
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218	NC_011889	GC	3	6	12589	12594	0 %	0 %	50 %	50 %	220915114

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.